81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4197 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 414 aa  252  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  41.79 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  41.26 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  40.36 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 416 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  32.01 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.62 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  29.86 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  33.11 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  27.76 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  26.67 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  31.9 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.07 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  24.91 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.85 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.85 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.84 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.41 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.36 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.84 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  27.85 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  26.7 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.84 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.41 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  30.49 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  30.23 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  36.51 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  28.74 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  31.39 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  25.73 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  28.57 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>