More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1959 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.69 
 
 		 221 aa  362  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 214 aa  337  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.24 
 
 		 214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.24 
 
 		 214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.3 
 
 		 214 aa  334  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.77 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.26 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 231 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.79 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 235 aa  264  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.8 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.49 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 221 aa  257  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.41 
 
 		 223 aa  254  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.3 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.13 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.55 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.43 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  56.87 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.89 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 222 aa  247  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.34 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 215 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 		 220 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  56.54 
 
 		 265 aa  244  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  52.11 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.85 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.67 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.5 
 
 		 220 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.36 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 221 aa  236  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.18 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.43 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  62 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.3 
 
 		 226 aa  234  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.3 
 
 		 226 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.79 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 		 221 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.04 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.28 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.49 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>