More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0200 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  64.85 
 
 
242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
425 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
232 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.98 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
264 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
204 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
221 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.22 
 
 
241 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.76 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.22 
 
 
927 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.53 
 
 
1115 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.53 
 
 
1115 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  34.53 
 
 
1119 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
235 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 
413 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
244 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.05 
 
 
373 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
233 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
368 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
404 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.53 
 
 
1115 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.09 
 
 
1115 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
240 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.89 
 
 
872 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.54 
 
 
241 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
217 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  34.18 
 
 
244 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 
264 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.16 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
305 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.24 
 
 
417 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
272 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
405 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
276 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
409 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
481 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
465 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
289 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
413 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
291 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
269 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
258 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
301 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
299 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 
275 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
258 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
430 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  32.42 
 
 
240 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.28 
 
 
1099 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 
294 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  29.9 
 
 
221 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  40.32 
 
 
237 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
261 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  38.04 
 
 
364 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.21 
 
 
373 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 
292 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
289 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 
683 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
263 aa  101  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
372 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.1 
 
 
479 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
1154 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
267 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
302 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.82 
 
 
244 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
324 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  38.36 
 
 
344 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 
238 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
352 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
286 aa  99.4  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>