More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4268 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46.79 
 
 		 4882 aa  820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.41 
 
 		 3148 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.1 
 
 		 4930 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.98 
 
 		 2078 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.5 
 
 		 3463 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 1577 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 3092 aa  1112    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.1 
 
 		 5400 aa  828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  46.34 
 
 		 2126 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.87 
 
 		 2719 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  45.89 
 
 		 2066 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.09 
 
 		 1548 aa  1036    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.18 
 
 		 4151 aa  857    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.75 
 
 		 3033 aa  991    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.71 
 
 		 7279 aa  1023    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.32 
 
 		 7210 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  51.1 
 
 		 4840 aa  868    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.42 
 
 		 1087 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 2551 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 1874 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 		 1656 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.31 
 
 		 3427 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.78 
 
 		 1587 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.63 
 
 		 1349 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  42.58 
 
 		 6768 aa  948    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.63 
 
 		 3930 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.95 
 
 		 3408 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.44 
 
 		 3508 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  41.3 
 
 		 1601 aa  905    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  42.77 
 
 		 1114 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 2880 aa  727    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.83 
 
 		 1559 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.76 
 
 		 2374 aa  797    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  54.42 
 
 		 1955 aa  1889    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.16 
 
 		 3711 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  56.01 
 
 		 2081 aa  1982    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 		 7110 aa  870    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.26 
 
 		 4165 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  47.52 
 
 		 2847 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.16 
 
 		 1837 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.54 
 
 		 1789 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.36 
 
 		 3693 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.77 
 
 		 1559 aa  781    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.44 
 
 		 3670 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 		 3874 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.37 
 
 		 2762 aa  801    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.24 
 
 		 3449 aa  911    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  50.48 
 
 		 4080 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  41.24 
 
 		 1584 aa  892    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.28 
 
 		 1867 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.11 
 
 		 4111 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  35.44 
 
 		 1537 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.89 
 
 		 4478 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.42 
 
 		 2090 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.98 
 
 		 2060 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.33 
 
 		 2376 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.36 
 
 		 3693 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.82 
 
 		 2277 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  46.85 
 
 		 2966 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.7 
 
 		 4575 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  46.1 
 
 		 3355 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.24 
 
 		 3676 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  44.37 
 
 		 2108 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 		 3696 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  100 
 
 		 2024 aa  3935    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.58 
 
 		 2113 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.61 
 
 		 1305 aa  666    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  35.29 
 
 		 1581 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  52.3 
 
 		 3254 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.75 
 
 		 1101 aa  819    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  46.31 
 
 		 3158 aa  1196    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.16 
 
 		 1602 aa  774    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 		 5255 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 		 5154 aa  995    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  46.26 
 
 		 1831 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  45.68 
 
 		 1143 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.55 
 
 		 3494 aa  797    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 3702 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.3 
 
 		 3281 aa  778    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  49.08 
 
 		 2107 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  44.28 
 
 		 1593 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.4 
 
 		 2846 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.37 
 
 		 1071 aa  799    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.06 
 
 		 1126 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.52 
 
 		 1349 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.73 
 
 		 2367 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.73 
 
 		 3679 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 3493 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  39.1 
 
 		 1573 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  38.88 
 
 		 4264 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.07 
 
 		 1816 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 1580 aa  636  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 1580 aa  636  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 1580 aa  635  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.52 
 
 		 4607 aa  632  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 		 3176 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.36 
 
 		 1354 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.85 
 
 		 2020 aa  622  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  43.39 
 
 		 1820 aa  616  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.97 
 
 		 1372 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>