More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3888 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 		 5400 aa  1052    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.65 
 
 		 1559 aa  765    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  54.82 
 
 		 4151 aa  1202    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  56.15 
 
 		 2126 aa  940    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 		 3176 aa  806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  44.65 
 
 		 1402 aa  723    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.58 
 
 		 3427 aa  894    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  57.22 
 
 		 3508 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 		 7110 aa  1280    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  58.59 
 
 		 1602 aa  939    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  47.99 
 
 		 2719 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  50.48 
 
 		 2066 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.05 
 
 		 1816 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  57.59 
 
 		 1593 aa  899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  57.25 
 
 		 1831 aa  951    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.27 
 
 		 1143 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 2551 aa  1054    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 1874 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.99 
 
 		 1656 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  51.36 
 
 		 4882 aa  1223    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 		 1587 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.37 
 
 		 4930 aa  1004    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.89 
 
 		 2374 aa  959    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 		 4111 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  46.62 
 
 		 1584 aa  1142    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  41.66 
 
 		 1349 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  57.7 
 
 		 1071 aa  861    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.12 
 
 		 1909 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  52.08 
 
 		 5255 aa  1128    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.83 
 
 		 3158 aa  1815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.79 
 
 		 1337 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  58.25 
 
 		 2367 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.38 
 
 		 3930 aa  1002    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.81 
 
 		 2081 aa  1286    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  46.77 
 
 		 1601 aa  1163    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.77 
 
 		 1349 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  56.18 
 
 		 3355 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  55.02 
 
 		 2060 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 3254 aa  6203    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  54.79 
 
 		 4575 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 3693 aa  901    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  54.61 
 
 		 3463 aa  1227    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 		 1520 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  50.32 
 
 		 1114 aa  848    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.66 
 
 		 1087 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  56.16 
 
 		 2107 aa  809    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.34 
 
 		 3874 aa  1018    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  59.8 
 
 		 2113 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  38.75 
 
 		 2551 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  53.57 
 
 		 1820 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  43.09 
 
 		 1354 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  46.13 
 
 		 3449 aa  1130    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  54.06 
 
 		 3670 aa  1068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 3645 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  55.56 
 
 		 1924 aa  863    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.01 
 
 		 1955 aa  1279    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  50.57 
 
 		 3148 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.11 
 
 		 4478 aa  867    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  57.19 
 
 		 3408 aa  928    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  47.84 
 
 		 1548 aa  935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 3693 aa  901    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  55.45 
 
 		 2376 aa  944    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 		 1520 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  46 
 
 		 2890 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  45.11 
 
 		 2880 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.93 
 
 		 6768 aa  1437    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  58.07 
 
 		 1789 aa  982    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 3676 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  44.22 
 
 		 2477 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.01 
 
 		 3696 aa  895    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  51.55 
 
 		 2847 aa  833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  54.83 
 
 		 2846 aa  831    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 		 1837 aa  808    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 1581 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.29 
 
 		 2762 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  52.9 
 
 		 5154 aa  1315    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.81 
 
 		 1372 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  53.18 
 
 		 4607 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 3092 aa  1410    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.47 
 
 		 1867 aa  871    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  52.62 
 
 		 2020 aa  818    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  51.19 
 
 		 3493 aa  1959    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  54.31 
 
 		 3711 aa  1229    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 		 2230 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 		 3702 aa  901    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.96 
 
 		 3033 aa  1316    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.94 
 
 		 4183 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.62 
 
 		 7279 aa  1625    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  42.97 
 
 		 3400 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.96 
 
 		 3494 aa  1125    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  47.41 
 
 		 2024 aa  1148    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  54.4 
 
 		 7210 aa  1390    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.67 
 
 		 2232 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.1 
 
 		 3679 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  36.75 
 
 		 3130 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  53.2 
 
 		 4080 aa  1251    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  54.34 
 
 		 4840 aa  1211    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  57.08 
 
 		 2966 aa  937    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.08 
 
 		 2136 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  52.59 
 
 		 2090 aa  820    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>