More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3467 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  100 
 
 
354 aa  697    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.62 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 
364 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.65 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 
362 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
374 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  32.56 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.22 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  33.64 
 
 
331 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  32.02 
 
 
354 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  30.28 
 
 
360 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  43.64 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  36.06 
 
 
333 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.53 
 
 
361 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30.36 
 
 
334 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  37.82 
 
 
362 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  37.82 
 
 
362 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  29.46 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.57 
 
 
347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.41 
 
 
341 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 
358 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  42.28 
 
 
334 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.17 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.8 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  27.91 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.69 
 
 
354 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  36.99 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28.41 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  36.42 
 
 
436 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  36.42 
 
 
436 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.41 
 
 
346 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  36.42 
 
 
436 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.64 
 
 
380 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.53 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  36.93 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.14 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.84 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.12 
 
 
328 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  30.93 
 
 
376 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.94 
 
 
347 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  34.7 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.43 
 
 
346 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.02 
 
 
358 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 
364 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.32 
 
 
321 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.67 
 
 
345 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  28.32 
 
 
315 aa  106  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.1 
 
 
355 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  37.85 
 
 
358 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.61 
 
 
343 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.09 
 
 
371 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.57 
 
 
346 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
329 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  31.58 
 
 
324 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  36.78 
 
 
415 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.82 
 
 
327 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.59 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.32 
 
 
342 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
336 aa  99.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
346 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  31.82 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  32.91 
 
 
308 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  32.59 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  32.59 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.21 
 
 
307 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  27.11 
 
 
348 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.04 
 
 
402 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  34.97 
 
 
372 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  33.71 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  29.38 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  32.8 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  28.91 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.22 
 
 
294 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  26.11 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.79 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  34.59 
 
 
438 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  32.79 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  31.2 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.57 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  28.31 
 
 
366 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.35 
 
 
383 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 
339 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.13 
 
 
372 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  30 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.05 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  31 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
422 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  32.32 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  28.04 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  31.79 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>