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for query gene Franean1_0670 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0670  major facilitator transporter  100 
 
 
484 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12328  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.39 
 
 
484 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2289  major facilitator transporter  47.06 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00392793  hitchhiker  0.000728467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 
460 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
476 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.06 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 
475 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6010  major facilitator superfamily MFS_1  56.16 
 
 
450 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.27 
 
 
489 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
461 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 
482 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
495 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
478 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 
475 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 
483 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
465 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.67 
 
 
500 aa  156  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
477 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  34.51 
 
 
510 aa  153  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 
477 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.71 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  32.74 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 
486 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 
505 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
480 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  29.43 
 
 
464 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3524  major facilitator family multidrug efflux transporter  31.71 
 
 
463 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.94 
 
 
492 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
488 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 
763 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 
554 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  30.63 
 
 
474 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.68 
 
 
462 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
474 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 
528 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.93 
 
 
488 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5269  major facilitator family transporter  32.23 
 
 
463 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
485 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.17 
 
 
466 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  32.85 
 
 
641 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  31.19 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
522 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.17 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
491 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
510 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 
496 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  27.7 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.77 
 
 
465 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.31 
 
 
479 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.77 
 
 
465 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 
501 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.24 
 
 
476 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
462 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 
478 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 
522 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  28.97 
 
 
470 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  29.31 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 
511 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
517 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 
607 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 
493 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
456 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  30.05 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  29.52 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 
482 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.25 
 
 
416 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 
504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.33 
 
 
470 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
478 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.06 
 
 
455 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 
458 aa  131  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 
569 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
483 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 
621 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  29.1 
 
 
582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
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NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  29.77 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30.63 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  29.54 
 
 
508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  30.14 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 
497 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.16 
 
 
537 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 
531 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 
478 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  27.41 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
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