More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2618 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 323 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  67.6 
 
 		 325 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  61.92 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  44 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  42.06 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  40.8 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.77 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  35.4 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  35.29 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  35.58 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  35.99 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  34.57 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  33.64 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  35.94 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  32.5 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  34.06 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  35.17 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  33.75 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  32.5 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  32.6 
 
 		 304 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  32.29 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  34.24 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  32.71 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  32.7 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  34.05 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  32.7 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  31.56 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  35.15 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  33.96 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  28.77 
 
 		 367 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  32.19 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  33.8 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  32.92 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  29.53 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  29.53 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  28.69 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  31.96 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  31.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  28.97 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  32.59 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  33.02 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  34.29 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  31.25 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  32.63 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  31.4 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  31.2 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  31.12 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  30.09 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  31.15 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  30.7 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  31.15 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  30.09 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  31.56 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  32.42 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1516  D-alanine--D-alanine ligase  33.76 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  30.55 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  32.72 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  32.42 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  31.95 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  31.41 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  30.37 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  32.52 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  27.84 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  32.82 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  30.37 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  30.37 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  32.91 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>