57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1953 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 460 aa  932    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  21.8 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.7 
 
 		 1656 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.7 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 461 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1040 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1097  hypothetical protein  32.23 
 
 		 276 aa  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 1095 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 987 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.83 
 
 		 914 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1107 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 947 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1073 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1557 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1110 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  23.91 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 776 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1085 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1101 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  22.41 
 
 		 698 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  23.49 
 
 		 334 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1017 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  21.57 
 
 		 508 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  27.38 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1105 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1047 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  23.24 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1098 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  21.59 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1138 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  34.07 
 
 		 1051 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1074 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1099 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 958 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  20.39 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  20.12 
 
 		 993 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.07 
 
 		 1018 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  23.14 
 
 		 990 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1034 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1062 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.21 
 
 		 833 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  21.76 
 
 		 321 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 793 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1086 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1173 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  17.9 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 872 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 759 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57620  predicted protein  24.02 
 
 		 635 aa  43.5  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.178714  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1071 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 1028 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  21.46 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>