134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1277 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1277  peptidase S41  100 
 
 		 547 aa  1121    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  33.08 
 
 		 747 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  21.71 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  22.99 
 
 		 447 aa  67  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  23.18 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  23.18 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  26.56 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.91 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  29.51 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  29.83 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  29.95 
 
 		 443 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  26.63 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  27.04 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 468 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  28.57 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  22.85 
 
 		 402 aa  53.5  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  30.11 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  22.07 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23.36 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  20.53 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  23.73 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  31.01 
 
 		 451 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  25.39 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  29.02 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 451 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  26.88 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  28.17 
 
 		 737 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 		 452 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  26.76 
 
 		 737 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  31.21 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  31.29 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  22.11 
 
 		 379 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  21.93 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 721 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  23.05 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  23.19 
 
 		 401 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  28.06 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 448 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  22.56 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 452 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  25 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  22.34 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  25.84 
 
 		 476 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  24.53 
 
 		 703 aa  47  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  27.66 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  27.66 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  24.86 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  20.61 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 1024 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  23.18 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  22.26 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.61 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  23.23 
 
 		 1104 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  27.52 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  22.13 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  27.15 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  31.48 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  28.85 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  22.89 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>