266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0556 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.85 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  29.92 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0880  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.81 
 
 		 643 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  30.61 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  32 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  35.37 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  34.73 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  31.72 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  30.68 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  32.14 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.09 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  31.74 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  32.37 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  30.94 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  28.8 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.43 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.03 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  30.85 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  42.15 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  26.55 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  27.57 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>