More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3106 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 359 aa  740    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  99.44 
 
 		 360 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  100 
 
 		 359 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 359 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 359 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  90.56 
 
 		 361 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 359 aa  740    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  90.56 
 
 		 361 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 360 aa  740    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  89.97 
 
 		 359 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  90.83 
 
 		 361 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  99.44 
 
 		 359 aa  740    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  99.44 
 
 		 359 aa  740    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  90.83 
 
 		 361 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  90.83 
 
 		 361 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  79.39 
 
 		 358 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  75.7 
 
 		 374 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  76.19 
 
 		 360 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  75.7 
 
 		 374 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  77.65 
 
 		 362 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  77.65 
 
 		 358 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  77.65 
 
 		 358 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  74.79 
 
 		 360 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  55.71 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  56.13 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  50.92 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  46.26 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  49.24 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  48.77 
 
 		 372 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  48.29 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.23 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  45 
 
 		 373 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  41.72 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 429 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  50 
 
 		 212 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  50 
 
 		 212 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 220 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  53.5 
 
 		 233 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  40.3 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  38.86 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 519 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  41.57 
 
 		 203 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  44.51 
 
 		 215 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  40.36 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  40.36 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  40.36 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  40.36 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  40.36 
 
 		 241 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  40.36 
 
 		 241 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  40.36 
 
 		 203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  40.36 
 
 		 241 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  40.36 
 
 		 203 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  38.26 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 218 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  37.39 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  30.48 
 
 		 603 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  36.52 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.17 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.47 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  40.18 
 
 		 661 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.45 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.34 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 616 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.72 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.72 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  36.28 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  31.01 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>