120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1172 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 173 aa  357  6e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  75.58 
 
 		 173 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  67.44 
 
 		 173 aa  246  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  68.06 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  56.32 
 
 		 178 aa  200  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  42.76 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 377 aa  64.3  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.06 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  32.28 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  29.59 
 
 		 380 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  36.45 
 
 		 423 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 278 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  23.81 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 119 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  28.7 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.93 
 
 		 247 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  37.31 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.23 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.19 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.15 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  30.25 
 
 		 480 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.43 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  29.32 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  27.56 
 
 		 118 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  28.45 
 
 		 401 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  42 
 
 		 114 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  28.1 
 
 		 112 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  26.36 
 
 		 121 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  39.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 470 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  37.7 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  37.7 
 
 		 406 aa  44.7  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  32.18 
 
 		 123 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 388 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  25.83 
 
 		 107 aa  44.3  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  32.86 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  40.32 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  26.45 
 
 		 346 aa  44.3  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.74 
 
 		 562 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  26.92 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.81 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  26.05 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  26.61 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  28.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  34.25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  27.54 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  40 
 
 		 119 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 226 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  23.85 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>