More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0356 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  47.04 
 
 
273 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  44.04 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  44.4 
 
 
285 aa  232  6e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 
289 aa  228  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  41.95 
 
 
295 aa  219  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  41.61 
 
 
293 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  41.24 
 
 
279 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  40.88 
 
 
277 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  40.88 
 
 
277 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  40.36 
 
 
289 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  39.92 
 
 
277 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  39.92 
 
 
277 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  39.92 
 
 
277 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  40.71 
 
 
277 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  42.13 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  41.27 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  38.98 
 
 
279 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  40.39 
 
 
277 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  41.7 
 
 
277 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  39.59 
 
 
279 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 
301 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
281 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  37.45 
 
 
281 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  40.65 
 
 
277 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  37.78 
 
 
283 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  38.28 
 
 
275 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  38.65 
 
 
275 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  38.15 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  38.85 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  37.64 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  37.4 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  37.73 
 
 
281 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  38.35 
 
 
293 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  38.35 
 
 
293 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  37.96 
 
 
279 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 
279 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 
281 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  38.18 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  39.45 
 
 
297 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  38.02 
 
 
301 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  35.4 
 
 
286 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
297 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  34.56 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  36.02 
 
 
297 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  36.08 
 
 
286 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  35.91 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  36.55 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  37.28 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
306 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  36.4 
 
 
296 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 
304 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  36.03 
 
 
305 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  37.3 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  37.98 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 
290 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
366 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  36.68 
 
 
312 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  34.8 
 
 
303 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  35.61 
 
 
291 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  36.51 
 
 
297 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 
296 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  35 
 
 
297 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
340 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  31.64 
 
 
270 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.48 
 
 
276 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.5 
 
 
289 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.88 
 
 
289 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.76 
 
 
284 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.71 
 
 
284 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  28.06 
 
 
283 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
272 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  30.52 
 
 
282 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  30.07 
 
 
320 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  28.63 
 
 
291 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.29 
 
 
290 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  27.82 
 
 
284 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.24 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
362 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  27.07 
 
 
321 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  30.24 
 
 
281 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  27.07 
 
 
321 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>