More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3462 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  89.66 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  83.69 
 
 		 234 aa  400  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  78.54 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  74.46 
 
 		 233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  77.16 
 
 		 233 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  76.72 
 
 		 233 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  76.72 
 
 		 233 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  76.29 
 
 		 237 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.03 
 
 		 233 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  76.29 
 
 		 237 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  74.46 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  64.47 
 
 		 237 aa  309  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  63.79 
 
 		 234 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.88 
 
 		 231 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  62.45 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  62.45 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  59.65 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  51.93 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.71 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.09 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  51.95 
 
 		 241 aa  231  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  51.32 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  48.71 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.28 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.57 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  49.34 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  49.37 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  50.65 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  47.9 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.68 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  52.34 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.73 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  47.68 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.22 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  51.87 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  49.14 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.86 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  48.71 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  48.71 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  47.83 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.98 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.86 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 245 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  50.64 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.75 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.05 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.83 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  45.3 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  47.41 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.98 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.52 
 
 		 254 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50.22 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  47.68 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  46.19 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>