More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2138 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  94.7 
 
 
150 aa  278  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  50.32 
 
 
161 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.42 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  36.24 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.1 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.42 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.51 
 
 
233 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.54 
 
 
333 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.89 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.66 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  35.19 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.86 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  34.46 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.25 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.17 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.86 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  35 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.97 
 
 
241 aa  72  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  34.04 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.47 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.5 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.44 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.33 
 
 
423 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  33.33 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.71 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.97 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.37 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 
229 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 
221 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
231 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.91 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.91 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.51 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  34.53 
 
 
417 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
427 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  30.82 
 
 
339 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.17 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.87 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.61 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 
404 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34.72 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  33.59 
 
 
330 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  32.09 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 
246 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.57 
 
 
209 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
236 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.3 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1021  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  38.85 
 
 
436 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  38.85 
 
 
433 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  37.5 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.27 
 
 
426 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30 
 
 
223 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  34.78 
 
 
211 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  31.88 
 
 
332 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
246 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  29.61 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.17 
 
 
215 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
225 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.97 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.59 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
228 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.57 
 
 
212 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  31.62 
 
 
217 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.21 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
279 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>