More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1021 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1021  CBS domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  309  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.13 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.34 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.7 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.21 
 
 
348 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  33.8 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0151  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.75 
 
 
304 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.39 
 
 
230 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0016  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.639879  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.68 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  36.03 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.57 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.33 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35 
 
 
246 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 
338 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.33 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.54 
 
 
243 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  32.86 
 
 
339 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  28.36 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.41 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.32 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.03 
 
 
423 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.37 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 
230 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.86 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  31.54 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  25.34 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
232 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.8 
 
 
332 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.39 
 
 
229 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  27.66 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 
148 aa  60.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.11 
 
 
339 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.1 
 
 
426 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  24.84 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  32.84 
 
 
427 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.09 
 
 
330 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.94 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.94 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
625 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.08 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
242 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.17 
 
 
231 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
301 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.79 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.28 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.79 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.45 
 
 
229 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.68 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  25.75 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  27.45 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.07 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  25 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.74 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  25.17 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
427 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.24 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.72 
 
 
216 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  27.94 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.28 
 
 
261 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  30.22 
 
 
313 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  34.75 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  27.97 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  27.15 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
428 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.86 
 
 
243 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
215 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.78 
 
 
648 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  27.45 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  22.37 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2623  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  37.04 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.52 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 
225 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.72 
 
 
216 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 
640 aa  55.1  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  29.55 
 
 
291 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.03 
 
 
226 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 
247 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.14 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.22 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
410 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>