More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1098 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  100 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  99 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  85.1 
 
 		 302 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  87.67 
 
 		 299 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  83.72 
 
 		 299 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  87.29 
 
 		 296 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  81.27 
 
 		 300 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  82.45 
 
 		 301 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  85.77 
 
 		 299 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  60 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  60.13 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  55.22 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  53.51 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  54.33 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  55.67 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  55.33 
 
 		 304 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  54.42 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  54.24 
 
 		 295 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  54.86 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  52.74 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  51.94 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  50.36 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  44.96 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  44.36 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  40.48 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.53 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  40.14 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  40.14 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  40.14 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  39.8 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  39.46 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  40.65 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  42.14 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  39.36 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  39.74 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  41.84 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  40.34 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  38.41 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  42.18 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  41.37 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  39 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  40.66 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  38.14 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  39.58 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  37.84 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  39.6 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  39.6 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  42.64 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.45 
 
 		 287 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  38.94 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  39 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  41.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  39.46 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  39.33 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  39.33 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  39.33 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  39.33 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.16 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  41.55 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  38.85 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  41.2 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  43.09 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  38.18 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  40.21 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  36.95 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  37.37 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  35.42 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  38.97 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.21 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  36.7 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  40.71 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  40.71 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  36.15 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.25 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  36.84 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  39.65 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  40.67 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  41.13 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  34.14 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  34.91 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  34.91 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.91 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  37.46 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  36.81 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  37.76 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  36.24 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  41.2 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  41.2 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  41.2 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  41.2 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  39.31 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  38.05 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  36.84 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  37.46 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>