More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2952 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  55.6 
 
 		 288 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.9 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.46 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.08 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.33 
 
 		 281 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  46.57 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  51.95 
 
 		 277 aa  244  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  48.34 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  47.6 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  43.96 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  47.13 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 287 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  48.66 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.29 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.21 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 314 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  47.99 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>