72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1521 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  35 
 
 		 1315 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  35 
 
 		 1315 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  34 
 
 		 1297 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  34 
 
 		 1297 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  34 
 
 		 1297 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.24 
 
 		 397 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  34 
 
 		 1259 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.46 
 
 		 887 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.56 
 
 		 1979 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.87 
 
 		 882 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1069 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 626 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.06 
 
 		 632 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 466 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1138 aa  47.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.82 
 
 		 661 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 906 aa  47.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.48 
 
 		 882 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 466 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 444 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 406 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  30.61 
 
 		 634 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 435 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 610 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 389 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 421 aa  44.7  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  28.48 
 
 		 538 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 792 aa  44.3  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.2 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1085 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.85 
 
 		 436 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 467 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  31 
 
 		 1313 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 808 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 662 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 2262 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 418 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 4489 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  20 
 
 		 905 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 886 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.69 
 
 		 557 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1162 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1178 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.77 
 
 		 725 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.29 
 
 		 587 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 387 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.31 
 
 		 883 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 1459 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1794  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 250 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.218592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 1162 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2026  tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 		 307 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 884 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 860 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 3145 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 878 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  32.2 
 
 		 729 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1458  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 		 524 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.726847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 3172 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 800 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 		 715 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  43.14 
 
 		 577 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 456 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  31.65 
 
 		 864 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 		 1694 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 610 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 		 979 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  45.24 
 
 		 577 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.82 
 
 		 566 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>