More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2124 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  100 
 
 		 301 aa  630  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  63.49 
 
 		 304 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  33.44 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  32.39 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  30.74 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  30.97 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  31.42 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  31.42 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  31.42 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  31.27 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.85 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  30.14 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.1 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.54 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.39 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  31.43 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.09 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.59 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.59 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.14 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.05 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  29.72 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.9 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.69 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.89 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  28.04 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.27 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.3 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.66 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  29.39 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.17 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.77 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.66 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.77 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.36 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  26.84 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.68 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.16 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  28.62 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  26.87 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.22 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.95 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  26.86 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>