186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0896 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  836    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.8 
 
 
412 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  34.65 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.36 
 
 
407 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  34.35 
 
 
404 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 
434 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  32.84 
 
 
330 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 
412 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  34.78 
 
 
441 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  33.17 
 
 
435 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.93 
 
 
430 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  36.53 
 
 
414 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  35.28 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  36.8 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.1 
 
 
440 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  29.48 
 
 
460 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.16 
 
 
414 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  35.22 
 
 
420 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  34.44 
 
 
415 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.75 
 
 
420 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  31.37 
 
 
419 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  32.12 
 
 
421 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  33.33 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  33.59 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  35.26 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  32.23 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.39 
 
 
435 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.47 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  36.07 
 
 
387 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.98 
 
 
420 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  32.59 
 
 
410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  29.78 
 
 
430 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  31.52 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  34.05 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.42 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.19 
 
 
410 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.85 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.21 
 
 
425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  32.22 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  34.41 
 
 
405 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  31.32 
 
 
417 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.34 
 
 
380 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 
444 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.69 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.03 
 
 
415 aa  120  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.83 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.59 
 
 
429 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.23 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.44 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.87 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.14 
 
 
434 aa  110  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.92 
 
 
407 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 
449 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.46 
 
 
429 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  30.23 
 
 
430 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  29.48 
 
 
411 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.86 
 
 
424 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  30.46 
 
 
391 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  27.13 
 
 
435 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  29.08 
 
 
429 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.4 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  29.03 
 
 
405 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  26.73 
 
 
435 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.56 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  26.59 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.85 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.89 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.55 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.94 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.57 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.96 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.08 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.85 
 
 
434 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.11 
 
 
430 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  26.65 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.96 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  34.33 
 
 
152 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  26.58 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.35 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.42 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.3 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.48 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  25 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.77 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.09 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  27.49 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  30.3 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.83 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  29.24 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.83 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.27 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.86 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>