147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_728 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  100 
 
 		 205 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  82.93 
 
 		 205 aa  358  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  84.66 
 
 		 189 aa  339  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  48.02 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  43.37 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  41.87 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  42.42 
 
 		 221 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  41.87 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  37.07 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  39.32 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  39.41 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  37.56 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  39.7 
 
 		 242 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.16 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  37.36 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  33.53 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.37 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.89 
 
 		 257 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.17 
 
 		 382 aa  104  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  31.67 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  30.77 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  33.33 
 
 		 247 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  33.68 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  31.84 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.28 
 
 		 246 aa  95.5  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  31.34 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  31.4 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  32 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.57 
 
 		 253 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  31.34 
 
 		 305 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.22 
 
 		 244 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.47 
 
 		 252 aa  91.3  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  30.06 
 
 		 252 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  30.36 
 
 		 248 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  28.81 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.25 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  34.38 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.28 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  31.66 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.91 
 
 		 375 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  32.34 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  32.34 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  33.16 
 
 		 256 aa  85.1  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  29.13 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  30.66 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.73 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  33.51 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  30.81 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  29.13 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.06 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  28.72 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  28.72 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  29.53 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  30.6 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  28.49 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.72 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  27.08 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  35.22 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  26.13 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  29.1 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  25.76 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.88 
 
 		 510 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  26.34 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  26.52 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  27.07 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  27.07 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  26.52 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  26.67 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.34 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  24.44 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.27 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  29.33 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  25 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.63 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.6 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.32 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  32.69 
 
 		 2454 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  25.25 
 
 		 3002 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  24.6 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  22.99 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  25 
 
 		 3021 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.98 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  26.37 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.19 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.62 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  30.13 
 
 		 2706 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>