225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2642 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2216  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.103623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  43.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  43.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.67 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.71 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  31.25 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  25.49 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.25 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  46.51 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.73 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>