60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2216 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2216  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.103623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  91.1 
 
 
146 aa  274  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
143 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
138 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
152 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  36.54 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
157 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
157 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
146 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  28 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  31.51 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.23 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
159 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
174 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
137 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>