More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1086 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1086  rare lipoprotein A  100 
 
 		 163 aa  316  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.463128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  41.73 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 360 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 360 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  32 
 
 		 267 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  50 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 367 aa  80.5  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  49.41 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  40.6 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  48.94 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  31.76 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  33.85 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  38.99 
 
 		 423 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  47.42 
 
 		 324 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 352 aa  77.4  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  56.58 
 
 		 358 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  41.05 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  41.49 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  45.92 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  51.76 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  56.58 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  35.94 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  40.59 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  48.42 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  43.75 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.57 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  43.75 
 
 		 273 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  42.42 
 
 		 265 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  46.32 
 
 		 297 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  54.41 
 
 		 361 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  54.41 
 
 		 361 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  37.1 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.48 
 
 		 286 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.24 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  55.22 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  43.16 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  55.22 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.92 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  39.36 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  42.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  39.25 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  50.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  31.62 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  39.36 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  45.83 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>