More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2535 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  100 
 
 
361 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  100 
 
 
361 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  50.92 
 
 
274 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  50.92 
 
 
274 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  41.04 
 
 
278 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  31.48 
 
 
324 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  42.61 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  54.39 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  43.66 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
339 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
321 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  41.85 
 
 
318 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  44.52 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  38.54 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  35.57 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  50 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  42.65 
 
 
263 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  36.68 
 
 
264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  35.94 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  34.5 
 
 
322 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  49.57 
 
 
282 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.37 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  37.79 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  44.44 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.31 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  39.31 
 
 
381 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  48.31 
 
 
284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  37.29 
 
 
275 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  37.1 
 
 
257 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  37.29 
 
 
275 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  47.15 
 
 
297 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  42.96 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  36.07 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  49.12 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  40.45 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  42.96 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  46.02 
 
 
239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  42.28 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.13 
 
 
260 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  39.08 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  38.73 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.3 
 
 
281 aa  110  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  46.43 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  46.43 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  36.57 
 
 
266 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  46.43 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  40.72 
 
 
335 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  43.22 
 
 
243 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  45.69 
 
 
240 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  45.61 
 
 
283 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  34.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
281 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
375 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  33.45 
 
 
352 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  45.13 
 
 
265 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
277 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  44.92 
 
 
259 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.81 
 
 
310 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  45 
 
 
171 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  33.9 
 
 
295 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.61 
 
 
280 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.61 
 
 
280 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.61 
 
 
280 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  37.14 
 
 
424 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
285 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
409 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  44.72 
 
 
360 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  44.72 
 
 
360 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  44.35 
 
 
423 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  45.95 
 
 
290 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
154 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  44.72 
 
 
360 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
238 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  38.12 
 
 
312 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  31.42 
 
 
408 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  31.13 
 
 
419 aa  106  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  44.14 
 
 
160 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  44.14 
 
 
160 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  44.25 
 
 
333 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  39.37 
 
 
364 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  47.75 
 
 
224 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  36.6 
 
 
293 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  31.13 
 
 
421 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  44.35 
 
 
342 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  44.35 
 
 
342 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  39.37 
 
 
364 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
169 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  45.08 
 
 
388 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
259 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  42.34 
 
 
273 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  42.34 
 
 
273 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  38.29 
 
 
254 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
361 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>