More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4774 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  49.04 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 275 aa  110  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 266 aa  110  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 275 aa  110  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  50.48 
 
 		 264 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  47.37 
 
 		 286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 323 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.75 
 
 		 239 aa  107  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 186 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.89 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  48.04 
 
 		 270 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  51 
 
 		 358 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  43.12 
 
 		 360 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  43.12 
 
 		 360 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 163 aa  103  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 423 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  46.36 
 
 		 270 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 285 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  51.04 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 339 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 293 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.42 
 
 		 249 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 324 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 279 aa  100  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 408 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 322 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 265 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 281 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  49.48 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  50 
 
 		 257 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 260 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  46 
 
 		 367 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.34 
 
 		 297 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 352 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  43.8 
 
 		 415 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 270 aa  98.6  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 335 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 277 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 259 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  44.63 
 
 		 261 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 277 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 277 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 281 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 277 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  44.34 
 
 		 258 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  45.71 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.48 
 
 		 321 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  49.48 
 
 		 318 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 322 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  43.43 
 
 		 263 aa  97.1  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 179 aa  97.1  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 382 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  44.79 
 
 		 211 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 283 aa  96.7  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  46.94 
 
 		 346 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 283 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 264 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  42.98 
 
 		 417 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 424 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 280 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 280 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 280 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 282 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 242 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 242 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  43.75 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  50 
 
 		 311 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  46.24 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  47.37 
 
 		 325 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 243 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>