288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0270 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.06 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  37.68 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  37.32 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  38.41 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  38.41 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  38.04 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  37.04 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  37.68 
 
 
397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  29.68 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  37.73 
 
 
308 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  37.05 
 
 
402 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  33.68 
 
 
312 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 
311 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
310 aa  99  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  34.08 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  36.9 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  35.92 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  35.92 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  35.92 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  36.9 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  35.92 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  35.92 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  35.29 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  38.32 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  35.23 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  34.36 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.56 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  32.88 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  33.56 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  32.96 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.8 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.98 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  31.48 
 
 
532 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  33.79 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  34.78 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  33.44 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  22.26 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  30.93 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  29.22 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  35.02 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  30.41 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  32.44 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.33 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  32.44 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.92 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  32.02 
 
 
359 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  29.37 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  33.12 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.9 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.65 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  31.63 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 
382 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.32 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  32 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  32.71 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  30.93 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.12 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.46 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  27.24 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.39 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  34.45 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.83 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  22.3 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.21 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.83 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  31.47 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.21 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  31.63 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  22.3 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.42 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  23.02 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.78 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.95 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  32.02 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>