More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4431 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 		 361 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  73.35 
 
 		 360 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  65.71 
 
 		 360 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  66.38 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  60.97 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  59.89 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  38.14 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  27.17 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.95 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  24.16 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.69 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  25.58 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  26.43 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 422 aa  95.9  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.12 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.87 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  24.02 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.2 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  26.88 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  26.49 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  25.32 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.09 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.06 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.33 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.22 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.1 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.63 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  29.1 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.66 
 
 		 378 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  23.45 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  25.48 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  26.89 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.23 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  27.38 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.85 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  24.79 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  24.03 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.07 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.85 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.01 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  26.48 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  23.28 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  27.61 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  24.2 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>