180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2250 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  58.87 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  49.36 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  49.55 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  37.83 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  35.56 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  31.56 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.44 
 
 		 251 aa  99  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 202 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  31.92 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  29.39 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  29.18 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.13 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  30.73 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.16 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  30.7 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  33.15 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  30.88 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  26.99 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  28.38 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  26.02 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  28.28 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  26.13 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>