192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0980 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  50 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  44.4 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  43.06 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  49.1 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  44.88 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  46.42 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  43.93 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  42.29 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  30.18 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  29.89 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  27.86 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  26.88 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  24.82 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  27.62 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.92 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.76 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  29.63 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  26.71 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  26.3 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  27.99 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  31.55 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  26.32 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  27.84 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.26 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.18 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.71 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  22.53 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.57 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  28.41 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.41 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.4 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  28.21 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.22 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.9 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.2 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.38 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  29.22 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.02 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.35 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.83 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.98 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  24.76 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.44 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.59 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.47 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.23 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.78 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  26.38 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.88 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.08 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.08 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.74 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  23.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.52 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  25.78 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.81 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  28.65 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.18 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  24.64 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.7 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.33 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.6 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.74 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  27.35 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>