More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1244 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  37.44 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.98 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.94 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.98 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.08 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.59 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.42 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.08 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  37.38 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.26 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  32.13 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.91 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.29 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  31.05 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  32.08 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.28 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  32.11 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  31.98 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  31.98 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  32.75 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  33.18 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.59 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  29.68 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.82 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  31.44 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  33.04 
 
 		 282 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  31.36 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.09 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.42 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  31.06 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  38.18 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  33.18 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  29.68 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.7 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  31 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.35 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.26 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.22 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  32.71 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  31.88 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  32.74 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  31.88 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  32.2 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.72 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.11 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.11 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  31.63 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.63 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  28.63 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>