More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0184 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0184  ATPase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  77.08 
 
 		 261 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  76.08 
 
 		 255 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  73.28 
 
 		 252 aa  364  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  71.14 
 
 		 257 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  65.61 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  55.6 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  57.85 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  57.81 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  55.28 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  52.03 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  52.67 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  53.36 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.85 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 244 aa  258  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50.8 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.92 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.33 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  50.41 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  48.13 
 
 		 242 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  48.13 
 
 		 242 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  49.59 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 246 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  51 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  52.07 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  51.84 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  50.62 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  47.58 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  48.78 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  51.03 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  49.4 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.92 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  50.61 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  49.03 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  48 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.61 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  47.33 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.33 
 
 		 244 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  47.18 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  51.02 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.42 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 247 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  49.22 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  47.95 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  49.8 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  48.59 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  47.08 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  49.4 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  47.93 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  47.18 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  50.62 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  47.92 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  48.76 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  48.75 
 
 		 245 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  46.34 
 
 		 253 aa  241  9e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  52.24 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  46.25 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  46.77 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  45.67 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>