More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2256 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.18 
 
 		 938 aa  1094    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.17 
 
 		 936 aa  1025    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.38 
 
 		 936 aa  1025    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  51.27 
 
 		 944 aa  995    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.93 
 
 		 923 aa  641    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  45.36 
 
 		 914 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.46 
 
 		 959 aa  1029    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  54.42 
 
 		 967 aa  1004    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.82 
 
 		 941 aa  1273    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.28 
 
 		 936 aa  1026    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  52.69 
 
 		 923 aa  958    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.95 
 
 		 936 aa  1017    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.14 
 
 		 939 aa  824    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 937 aa  1929    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  54.82 
 
 		 940 aa  1028    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.05 
 
 		 992 aa  764    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.75 
 
 		 934 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.39 
 
 		 978 aa  1028    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  65.64 
 
 		 943 aa  1280    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.46 
 
 		 967 aa  1039    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  57.02 
 
 		 960 aa  1024    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  44.98 
 
 		 983 aa  855    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  44.66 
 
 		 934 aa  801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  54.63 
 
 		 961 aa  998    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  54.48 
 
 		 955 aa  998    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.77 
 
 		 934 aa  805    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.01 
 
 		 934 aa  826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  54.8 
 
 		 961 aa  1040    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.55 
 
 		 934 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.95 
 
 		 942 aa  810    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  45.23 
 
 		 955 aa  807    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  54.56 
 
 		 941 aa  1031    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  53.32 
 
 		 959 aa  1006    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  48.05 
 
 		 949 aa  880    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  48.39 
 
 		 951 aa  871    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  55.1 
 
 		 938 aa  1043    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  64.03 
 
 		 942 aa  1259    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.03 
 
 		 934 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  47.52 
 
 		 937 aa  871    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.92 
 
 		 934 aa  809    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.75 
 
 		 934 aa  825    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  54.52 
 
 		 938 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.53 
 
 		 941 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.28 
 
 		 943 aa  990    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.66 
 
 		 934 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.92 
 
 		 934 aa  806    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.58 
 
 		 934 aa  788    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 		 973 aa  661    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  44.39 
 
 		 935 aa  805    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.96 
 
 		 923 aa  635  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.29 
 
 		 966 aa  621  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  38.76 
 
 		 955 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.84 
 
 		 966 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.28 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 		 967 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 973 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.59 
 
 		 989 aa  207  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 		 1000 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.92 
 
 		 995 aa  202  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 996 aa  202  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.92 
 
 		 1037 aa  201  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  26 
 
 		 983 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.59 
 
 		 984 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 978 aa  193  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.12 
 
 		 975 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 997 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  25.68 
 
 		 976 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.43 
 
 		 971 aa  188  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.97 
 
 		 991 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 950 aa  188  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  25.26 
 
 		 1032 aa  187  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  24.79 
 
 		 930 aa  187  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.35 
 
 		 990 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.36 
 
 		 1007 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.59 
 
 		 1031 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  25.93 
 
 		 952 aa  184  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.19 
 
 		 967 aa  184  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.75 
 
 		 1015 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.39 
 
 		 1007 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.45 
 
 		 990 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  25.3 
 
 		 974 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  24.7 
 
 		 1024 aa  180  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.81 
 
 		 961 aa  179  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.39 
 
 		 1011 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 		 976 aa  179  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.81 
 
 		 1005 aa  179  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1022 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.32 
 
 		 1035 aa  177  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.52 
 
 		 1055 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24 
 
 		 973 aa  176  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.43 
 
 		 962 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 		 1024 aa  173  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.51 
 
 		 999 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.54 
 
 		 968 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.03 
 
 		 974 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.47 
 
 		 1046 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 999 aa  172  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.6 
 
 		 990 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  25.69 
 
 		 1010 aa  171  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.2 
 
 		 983 aa  171  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>