More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11033 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.05 
 
 		 976 aa  1031    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.75 
 
 		 1009 aa  923    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  37.62 
 
 		 973 aa  686    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.94 
 
 		 978 aa  723    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.6 
 
 		 1011 aa  975    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42.02 
 
 		 967 aa  773    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 967 aa  2001    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.61 
 
 		 968 aa  1139    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.87 
 
 		 977 aa  981    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.28 
 
 		 930 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.5 
 
 		 1034 aa  878    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.66 
 
 		 971 aa  1133    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.7 
 
 		 983 aa  934    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 		 976 aa  713    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  50.51 
 
 		 975 aa  1030    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.78 
 
 		 991 aa  959    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  35.04 
 
 		 952 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.91 
 
 		 1007 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.4 
 
 		 984 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.37 
 
 		 962 aa  588  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.02 
 
 		 1025 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 1038 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.87 
 
 		 1024 aa  581  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 		 1005 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 		 1035 aa  571  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 1014 aa  569  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 		 996 aa  571  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.34 
 
 		 990 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.97 
 
 		 1023 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 		 1025 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.14 
 
 		 990 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.03 
 
 		 989 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.17 
 
 		 1046 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 1055 aa  561  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.03 
 
 		 1015 aa  560  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.27 
 
 		 990 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.68 
 
 		 1032 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 		 961 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.08 
 
 		 995 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.63 
 
 		 1007 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.91 
 
 		 1070 aa  551  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 983 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 973 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.3 
 
 		 1032 aa  542  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 		 974 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.92 
 
 		 999 aa  529  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 999 aa  516  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  31.6 
 
 		 984 aa  502  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  32.48 
 
 		 1013 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.82 
 
 		 945 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  31.27 
 
 		 1015 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  31.63 
 
 		 1024 aa  496  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.78 
 
 		 987 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 1050 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1050 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  30.71 
 
 		 1052 aa  483  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.7 
 
 		 950 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.37 
 
 		 989 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.96 
 
 		 1037 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  30.96 
 
 		 1023 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 1006 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.94 
 
 		 948 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 1002 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.76 
 
 		 1031 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 1022 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.86 
 
 		 973 aa  466  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 		 976 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.41 
 
 		 974 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 		 985 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1031 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 976 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 		 975 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1000 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.56 
 
 		 1024 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.6 
 
 		 1013 aa  429  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.23 
 
 		 947 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1028 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.29 
 
 		 1006 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  29.84 
 
 		 1010 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 		 944 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 997 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 894 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1005 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.41 
 
 		 966 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  29.68 
 
 		 1015 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1027 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.21 
 
 		 1018 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  29.1 
 
 		 1021 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 		 1019 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 		 1006 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.84 
 
 		 1015 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 1006 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  28.6 
 
 		 1018 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1018 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.88 
 
 		 995 aa  416  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 1006 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.13 
 
 		 1023 aa  416  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.16 
 
 		 906 aa  416  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  29.47 
 
 		 1011 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>