More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1924 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.23 
 
 		 991 aa  737    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.07 
 
 		 976 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.49 
 
 		 1011 aa  750    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 967 aa  1964    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.16 
 
 		 1009 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.58 
 
 		 968 aa  729    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  42.02 
 
 		 967 aa  758    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.96 
 
 		 977 aa  741    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  39.01 
 
 		 930 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.72 
 
 		 971 aa  731    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  42.24 
 
 		 975 aa  783    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.63 
 
 		 1034 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.69 
 
 		 978 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.88 
 
 		 976 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.23 
 
 		 983 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  42 
 
 		 973 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 962 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  38.18 
 
 		 973 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.31 
 
 		 995 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.63 
 
 		 989 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.86 
 
 		 961 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.2 
 
 		 1007 aa  552  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.68 
 
 		 984 aa  549  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.56 
 
 		 990 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.73 
 
 		 1007 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.05 
 
 		 952 aa  549  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 		 990 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 		 1015 aa  536  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.24 
 
 		 1025 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  36.93 
 
 		 1024 aa  539  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.39 
 
 		 990 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.22 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.28 
 
 		 1005 aa  532  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  38.09 
 
 		 974 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.71 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 		 983 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  36.18 
 
 		 1015 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.91 
 
 		 1032 aa  522  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 1035 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.86 
 
 		 1046 aa  512  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.35 
 
 		 1024 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.04 
 
 		 999 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.91 
 
 		 984 aa  505  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 		 1014 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 		 1023 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 999 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 		 1052 aa  496  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 		 1050 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  36.38 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 		 996 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.53 
 
 		 1055 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.01 
 
 		 1013 aa  489  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.18 
 
 		 1037 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 		 987 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 1070 aa  479  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 		 976 aa  476  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.4 
 
 		 1032 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.31 
 
 		 1031 aa  473  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.44 
 
 		 966 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 		 1022 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 		 1023 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.97 
 
 		 945 aa  459  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 		 976 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 1000 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 1043 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.15 
 
 		 948 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 950 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.89 
 
 		 973 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  34.39 
 
 		 894 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.07 
 
 		 974 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 		 1006 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  33.2 
 
 		 949 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 1002 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.07 
 
 		 1006 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.46 
 
 		 989 aa  415  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 		 975 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  33.2 
 
 		 985 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  31.04 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 1027 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  31.04 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1031 aa  399  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.1 
 
 		 944 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 1018 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  30.92 
 
 		 1018 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  30.94 
 
 		 1018 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  28.74 
 
 		 1016 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.04 
 
 		 1018 aa  396  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.73 
 
 		 1013 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1023 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  31.05 
 
 		 1018 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1021 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  30.65 
 
 		 1018 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.37 
 
 		 997 aa  393  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1011 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  32.25 
 
 		 1010 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  30.54 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  31.56 
 
 		 997 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.34 
 
 		 995 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>