More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0686 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.69 
 
 
950 aa  977    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.95 
 
 
995 aa  974    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 
1037 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 
976 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.16 
 
 
1022 aa  740    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 
1015 aa  718    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  47.9 
 
 
949 aa  749    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.68 
 
 
966 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.87 
 
 
989 aa  906    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  41.33 
 
 
984 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.57 
 
 
977 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  44.92 
 
 
1043 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.58 
 
 
947 aa  975    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  45.83 
 
 
1052 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  52.03 
 
 
976 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  45.34 
 
 
1050 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.21 
 
 
1006 aa  1098    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.84 
 
 
1031 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  66.05 
 
 
974 aa  1214    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
985 aa  1934    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  52.07 
 
 
945 aa  880    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  62.39 
 
 
1010 aa  1143    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  41.67 
 
 
1013 aa  709    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  44.38 
 
 
1024 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  50.05 
 
 
987 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  66.73 
 
 
997 aa  1194    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  44.62 
 
 
993 aa  707    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  45.73 
 
 
1050 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 
1028 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.65 
 
 
944 aa  955    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.21 
 
 
973 aa  1219    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  47.88 
 
 
894 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  56.22 
 
 
975 aa  1005    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.59 
 
 
948 aa  974    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.65 
 
 
997 aa  967    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.31 
 
 
1050 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.4 
 
 
906 aa  858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.3 
 
 
1000 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
999 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.36 
 
 
999 aa  612  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  34.79 
 
 
973 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.17 
 
 
978 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  37.28 
 
 
952 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 
1024 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.58 
 
 
976 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 
983 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.18 
 
 
1023 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.47 
 
 
962 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.73 
 
 
967 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.4 
 
 
995 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.47 
 
 
1007 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.62 
 
 
1035 aa  446  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.75 
 
 
1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.2 
 
 
961 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.27 
 
 
1015 aa  438  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.77 
 
 
984 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 
991 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.79 
 
 
1025 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  32.36 
 
 
996 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  33.07 
 
 
1055 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.32 
 
 
990 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  33.79 
 
 
1007 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.43 
 
 
1011 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.18 
 
 
971 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.16 
 
 
990 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.24 
 
 
1009 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 
990 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  33.63 
 
 
967 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 
989 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 
973 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  34.31 
 
 
974 aa  426  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.8 
 
 
1034 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.03 
 
 
1005 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 
968 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  33.27 
 
 
1014 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.49 
 
 
983 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.71 
 
 
976 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 
1025 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33 
 
 
1032 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.99 
 
 
1046 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 
1070 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  29.05 
 
 
975 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.95 
 
 
977 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 
1032 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
1023 aa  399  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  30.11 
 
 
930 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 
1024 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 
1002 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.96 
 
 
1006 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.99 
 
 
1026 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  27.48 
 
 
1016 aa  324  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.32 
 
 
1015 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.15 
 
 
1015 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.42 
 
 
1023 aa  322  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  25.07 
 
 
1031 aa  321  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2548  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.76 
 
 
1016 aa  317  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.84 
 
 
1027 aa  317  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  27.2 
 
 
1013 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.38 
 
 
1007 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.77 
 
 
1019 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>