More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3429 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.45 
 
 		 1009 aa  1107    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 976 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.8 
 
 		 968 aa  1013    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  50.51 
 
 		 967 aa  1009    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.99 
 
 		 1011 aa  1052    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42.24 
 
 		 967 aa  783    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  40.08 
 
 		 973 aa  740    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.69 
 
 		 991 aa  1181    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.41 
 
 		 930 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.23 
 
 		 983 aa  1042    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.26 
 
 		 977 aa  1156    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.05 
 
 		 971 aa  1025    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  100 
 
 		 975 aa  2028    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 		 978 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.66 
 
 		 1034 aa  1048    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.12 
 
 		 976 aa  1244    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 		 962 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  36.5 
 
 		 952 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.34 
 
 		 1014 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.23 
 
 		 996 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  36.72 
 
 		 973 aa  582  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.5 
 
 		 1024 aa  568  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.69 
 
 		 1007 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.05 
 
 		 984 aa  562  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.85 
 
 		 1038 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.19 
 
 		 961 aa  553  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.43 
 
 		 1005 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 		 983 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.4 
 
 		 995 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 		 1035 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.41 
 
 		 989 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.37 
 
 		 1032 aa  545  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 		 1007 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 		 974 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.35 
 
 		 990 aa  545  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.08 
 
 		 990 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.9 
 
 		 1015 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 		 990 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 1024 aa  541  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 		 1055 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 999 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.94 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 		 1015 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.06 
 
 		 999 aa  532  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 984 aa  529  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.75 
 
 		 1046 aa  529  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.01 
 
 		 1025 aa  526  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.04 
 
 		 1032 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.03 
 
 		 1023 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  33.74 
 
 		 1013 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  31.27 
 
 		 1070 aa  514  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 		 976 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1050 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 		 1050 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  32.65 
 
 		 1052 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 		 1023 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 		 987 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.53 
 
 		 1031 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 		 1037 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 		 1006 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1022 aa  476  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.4 
 
 		 966 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 1002 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  32.12 
 
 		 975 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.16 
 
 		 945 aa  459  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.08 
 
 		 948 aa  459  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 		 1043 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.82 
 
 		 973 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.74 
 
 		 1010 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 		 1000 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.62 
 
 		 1026 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 1023 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 		 976 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.64 
 
 		 974 aa  426  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.39 
 
 		 1015 aa  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.15 
 
 		 1024 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 		 1005 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.13 
 
 		 947 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.44 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 		 1013 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1027 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.96 
 
 		 1024 aa  422  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 950 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.64 
 
 		 1013 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.82 
 
 		 1018 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 		 1021 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 		 1013 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 1017 aa  419  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 		 1013 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.46 
 
 		 1013 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.31 
 
 		 1015 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  29.54 
 
 		 1016 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 1018 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.44 
 
 		 1013 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.12 
 
 		 1017 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 1013 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 		 1028 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 997 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 1013 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>