More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2417 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.06 
 
 		 978 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 976 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42.96 
 
 		 967 aa  758    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.51 
 
 		 930 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.14 
 
 		 1009 aa  1234    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.83 
 
 		 991 aa  1285    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.09 
 
 		 1011 aa  1117    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  57.26 
 
 		 975 aa  1180    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  50.87 
 
 		 967 aa  982    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 977 aa  2033    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.36 
 
 		 983 aa  1070    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.7 
 
 		 971 aa  1020    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.82 
 
 		 968 aa  985    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  39.9 
 
 		 973 aa  691    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.61 
 
 		 976 aa  1391    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.28 
 
 		 962 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.88 
 
 		 1034 aa  1049    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.82 
 
 		 952 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.83 
 
 		 1007 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  36.92 
 
 		 973 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.16 
 
 		 984 aa  602  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.55 
 
 		 961 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.5 
 
 		 1007 aa  592  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 		 1038 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.99 
 
 		 1025 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.27 
 
 		 1005 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  36.49 
 
 		 1014 aa  582  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.37 
 
 		 990 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.98 
 
 		 1046 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 		 1025 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.26 
 
 		 983 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  36 
 
 		 996 aa  572  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.34 
 
 		 1015 aa  567  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.84 
 
 		 995 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.92 
 
 		 990 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.46 
 
 		 989 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  36.41 
 
 		 974 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.51 
 
 		 990 aa  562  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.29 
 
 		 1032 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 		 1055 aa  545  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 		 1035 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 		 1024 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 		 1070 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.7 
 
 		 1024 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.96 
 
 		 1032 aa  535  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.78 
 
 		 1023 aa  536  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 		 999 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 999 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.75 
 
 		 984 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.09 
 
 		 945 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 		 976 aa  499  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1050 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  32.42 
 
 		 1013 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  33.07 
 
 		 987 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 		 1023 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  32.51 
 
 		 1015 aa  492  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.89 
 
 		 1031 aa  492  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  34.05 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  33.61 
 
 		 1052 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.19 
 
 		 950 aa  479  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 		 1037 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 1022 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.88 
 
 		 973 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.35 
 
 		 966 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.94 
 
 		 989 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 		 1043 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  30.53 
 
 		 1013 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 		 1018 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  30.35 
 
 		 1018 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 		 975 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  30.96 
 
 		 1018 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1018 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  30.35 
 
 		 1018 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1018 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31 
 
 		 974 aa  452  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  30.35 
 
 		 1018 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  30.35 
 
 		 1018 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  30.35 
 
 		 1018 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 		 1018 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  30.35 
 
 		 1018 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.97 
 
 		 1024 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  30.81 
 
 		 1018 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  30.35 
 
 		 1018 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.04 
 
 		 1028 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  31.13 
 
 		 1010 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  30.86 
 
 		 1018 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  30.76 
 
 		 1018 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 1021 aa  442  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 1002 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.72 
 
 		 947 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.15 
 
 		 948 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.79 
 
 		 1015 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 		 1022 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 1000 aa  439  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 		 1017 aa  439  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 1026 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.82 
 
 		 1024 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  28.78 
 
 		 1016 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 1023 aa  436  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>