More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3025 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.49 
 
 
962 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 
978 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  53.68 
 
 
984 aa  1023    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.07 
 
 
989 aa  1023    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  75.39 
 
 
1007 aa  1617    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.27 
 
 
990 aa  983    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  75.22 
 
 
1005 aa  1593    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  39.36 
 
 
973 aa  685    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
1038 aa  2127    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.92 
 
 
983 aa  984    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  51.32 
 
 
973 aa  972    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.75 
 
 
961 aa  939    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.97 
 
 
1046 aa  1182    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.83 
 
 
1032 aa  1196    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  67.54 
 
 
1007 aa  1406    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.99 
 
 
995 aa  964    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.94 
 
 
1025 aa  1199    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  52.3 
 
 
974 aa  958    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.27 
 
 
990 aa  984    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.97 
 
 
990 aa  975    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.74 
 
 
1025 aa  1167    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.32 
 
 
976 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.33 
 
 
952 aa  598  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 
1011 aa  594  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37 
 
 
1034 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.38 
 
 
1014 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 
1009 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 
971 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 
996 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.48 
 
 
977 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.72 
 
 
976 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  32.98 
 
 
967 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  35.55 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  34.04 
 
 
975 aa  557  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.83 
 
 
991 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.97 
 
 
983 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.62 
 
 
968 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.96 
 
 
1015 aa  555  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 
1024 aa  549  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.39 
 
 
1035 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
999 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.9 
 
 
999 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.3 
 
 
1023 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 
1032 aa  538  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  35.28 
 
 
967 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.75 
 
 
1023 aa  528  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.83 
 
 
1070 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
1055 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  34.21 
 
 
1013 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 
1015 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.77 
 
 
1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.69 
 
 
989 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.43 
 
 
966 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.92 
 
 
984 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
976 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.39 
 
 
1037 aa  489  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  32.17 
 
 
930 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 
1022 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 
1050 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  35.62 
 
 
1050 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.98 
 
 
1052 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 
987 aa  482  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
1000 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  34.1 
 
 
1043 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.27 
 
 
948 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.46 
 
 
950 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  34.82 
 
 
976 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  35.7 
 
 
894 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 
1006 aa  459  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.48 
 
 
973 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.5 
 
 
945 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  34.23 
 
 
975 aa  449  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
944 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 
997 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.71 
 
 
974 aa  442  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 
1010 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
985 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 
997 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
906 aa  429  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  32.18 
 
 
949 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  28.14 
 
 
1002 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.7 
 
 
1028 aa  409  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32 
 
 
1050 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.2 
 
 
1006 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  49.29 
 
 
420 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  30.22 
 
 
1012 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.41 
 
 
1024 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.53 
 
 
947 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.12 
 
 
995 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.83 
 
 
1023 aa  376  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.11 
 
 
1027 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  28.45 
 
 
1013 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.37 
 
 
977 aa  364  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 
1017 aa  364  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.72 
 
 
1013 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
1021 aa  363  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
1023 aa  362  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
1022 aa  362  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 
1013 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 
1013 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>