More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2125 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.1 
 
 
947 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  49.04 
 
 
987 aa  899    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.87 
 
 
989 aa  709    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  42.83 
 
 
976 aa  727    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.12 
 
 
974 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  44.08 
 
 
894 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.89 
 
 
1050 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  44.08 
 
 
975 aa  754    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  61.54 
 
 
1050 aa  1170    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  42.05 
 
 
949 aa  705    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  55.33 
 
 
966 aa  1077    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.36 
 
 
950 aa  733    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  60.84 
 
 
984 aa  1230    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  52.75 
 
 
1043 aa  987    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  56.01 
 
 
976 aa  1112    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 
985 aa  690    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  61.66 
 
 
1050 aa  1176    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.12 
 
 
1006 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.46 
 
 
1031 aa  1054    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.13 
 
 
948 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  53.96 
 
 
999 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.02 
 
 
973 aa  748    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  61.41 
 
 
1052 aa  1167    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  58.37 
 
 
1013 aa  1180    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  40.68 
 
 
997 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  59.24 
 
 
1024 aa  1175    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.62 
 
 
1022 aa  1010    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.36 
 
 
944 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.67 
 
 
995 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
1015 aa  2081    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.98 
 
 
1028 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.95 
 
 
945 aa  926    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.66 
 
 
1037 aa  1041    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.05 
 
 
997 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.46 
 
 
1000 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  42.13 
 
 
1010 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.34 
 
 
999 aa  1027    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 
993 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.19 
 
 
976 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 
973 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.62 
 
 
978 aa  611  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.06 
 
 
906 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.18 
 
 
977 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.7 
 
 
1007 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.96 
 
 
952 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 
1015 aa  559  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  36.18 
 
 
996 aa  557  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
1070 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 
983 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.25 
 
 
991 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 
1005 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  36.26 
 
 
1055 aa  547  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  37.13 
 
 
1007 aa  546  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  36.17 
 
 
1024 aa  542  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.22 
 
 
1046 aa  542  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.79 
 
 
1014 aa  535  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.02 
 
 
961 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.48 
 
 
1035 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.62 
 
 
1025 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  33.64 
 
 
975 aa  530  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  36.18 
 
 
967 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 
1009 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.26 
 
 
1025 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 
1023 aa  526  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.67 
 
 
962 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 
989 aa  522  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.28 
 
 
984 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.52 
 
 
1032 aa  522  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 
995 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.2 
 
 
1038 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.19 
 
 
990 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33 
 
 
976 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 
973 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.98 
 
 
990 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 
990 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 
1032 aa  509  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.91 
 
 
1034 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.64 
 
 
971 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 
1011 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  31.17 
 
 
967 aa  485  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 
1023 aa  482  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 
983 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.28 
 
 
974 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.51 
 
 
977 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.6 
 
 
968 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.28 
 
 
930 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
1002 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
1006 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 
1024 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
1012 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 
1027 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 
1006 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 
1017 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  29 
 
 
1017 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  27.58 
 
 
1016 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 
1067 aa  356  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  27.53 
 
 
1013 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 
1005 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.07 
 
 
1006 aa  356  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 
1017 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>