More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4574 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  76.81 
 
 		 974 aa  1459    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.16 
 
 		 978 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.82 
 
 		 1007 aa  1016    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  54.93 
 
 		 984 aa  1013    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.61 
 
 		 1005 aa  995    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  77.1 
 
 		 983 aa  1508    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.33 
 
 		 989 aa  1067    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.87 
 
 		 1038 aa  986    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  98.08 
 
 		 990 aa  1989    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.99 
 
 		 1032 aa  990    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.49 
 
 		 1025 aa  933    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.68 
 
 		 961 aa  998    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.25 
 
 		 1046 aa  956    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 		 973 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 990 aa  2018    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  55.92 
 
 		 1007 aa  1022    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  83.9 
 
 		 995 aa  1667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.02 
 
 		 1025 aa  996    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  95.66 
 
 		 990 aa  1881    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  54.86 
 
 		 973 aa  1000    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.68 
 
 		 976 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.87 
 
 		 962 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.49 
 
 		 968 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.8 
 
 		 952 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 		 996 aa  582  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.65 
 
 		 1014 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.9 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.92 
 
 		 977 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.31 
 
 		 1034 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.21 
 
 		 991 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 		 1031 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  34.28 
 
 		 967 aa  559  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.95 
 
 		 1015 aa  555  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  37.73 
 
 		 967 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  36.34 
 
 		 1032 aa  549  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.34 
 
 		 1009 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.27 
 
 		 1011 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  34.04 
 
 		 975 aa  547  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  36.22 
 
 		 1024 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.21 
 
 		 976 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.33 
 
 		 999 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.26 
 
 		 983 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.05 
 
 		 1013 aa  539  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  35.72 
 
 		 999 aa  536  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.08 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.85 
 
 		 1037 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.51 
 
 		 1035 aa  531  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.16 
 
 		 1023 aa  528  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  35.19 
 
 		 1015 aa  525  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 		 1070 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.33 
 
 		 1055 aa  522  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.95 
 
 		 1022 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  37.41 
 
 		 976 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  35.32 
 
 		 1043 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  37.88 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 		 987 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.43 
 
 		 966 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1050 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 		 1023 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  37.46 
 
 		 1052 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.21 
 
 		 945 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 976 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.67 
 
 		 984 aa  492  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 1000 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  32.74 
 
 		 930 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.73 
 
 		 948 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  36.21 
 
 		 949 aa  475  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.6 
 
 		 950 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.31 
 
 		 989 aa  462  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  35.36 
 
 		 975 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 973 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 1028 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.47 
 
 		 974 aa  445  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  36.41 
 
 		 894 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.61 
 
 		 1006 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 		 997 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  33.6 
 
 		 985 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  33.3 
 
 		 1010 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 906 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 1002 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.04 
 
 		 1050 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 1006 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.78 
 
 		 997 aa  406  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.44 
 
 		 944 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.74 
 
 		 947 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  34.67 
 
 		 993 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.35 
 
 		 995 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.54 
 
 		 977 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 1012 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 		 1023 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.91 
 
 		 1027 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  31.83 
 
 		 978 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  28.97 
 
 		 966 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  30.01 
 
 		 1021 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.16 
 
 		 1013 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.55 
 
 		 1018 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.14 
 
 		 1024 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  29.67 
 
 		 1016 aa  376  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.35 
 
 		 1018 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>