More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0601 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.85 
 
 
977 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  70.21 
 
 
974 aa  1327    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  66.2 
 
 
1010 aa  1256    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.69 
 
 
1022 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  47.8 
 
 
894 aa  745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  47.5 
 
 
949 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.78 
 
 
966 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  44.57 
 
 
1043 aa  744    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  40.36 
 
 
984 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.03 
 
 
1050 aa  1064    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.92 
 
 
1037 aa  753    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  53.35 
 
 
989 aa  927    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.65 
 
 
945 aa  848    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  66.9 
 
 
985 aa  1201    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  43.81 
 
 
1050 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.62 
 
 
1006 aa  1125    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.34 
 
 
1031 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 
1015 aa  702    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  66.94 
 
 
973 aa  1297    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.19 
 
 
948 aa  962    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  38.58 
 
 
976 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  55.92 
 
 
975 aa  1019    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  40.78 
 
 
1013 aa  709    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  41.77 
 
 
1024 aa  695    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  43.38 
 
 
993 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
997 aa  1976    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.25 
 
 
950 aa  964    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  43.91 
 
 
1050 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 
1028 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  43.81 
 
 
1052 aa  686    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  51.53 
 
 
976 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.2 
 
 
995 aa  1015    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.43 
 
 
997 aa  996    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.33 
 
 
906 aa  861    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.43 
 
 
1000 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.47 
 
 
944 aa  966    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.36 
 
 
947 aa  1009    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  50.84 
 
 
987 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.37 
 
 
999 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
999 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.75 
 
 
978 aa  515  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
973 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.77 
 
 
976 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  36.13 
 
 
952 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 
1007 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.95 
 
 
984 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.23 
 
 
1005 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.37 
 
 
1038 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 
983 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 
962 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.79 
 
 
990 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.86 
 
 
990 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.35 
 
 
977 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.5 
 
 
990 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.15 
 
 
974 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.39 
 
 
971 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.08 
 
 
1009 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.15 
 
 
991 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 
995 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.09 
 
 
1007 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.91 
 
 
1025 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  31.98 
 
 
1055 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.08 
 
 
1032 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.07 
 
 
976 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.64 
 
 
1025 aa  426  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.9 
 
 
1035 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.74 
 
 
961 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.85 
 
 
968 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.5 
 
 
989 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  31.79 
 
 
1024 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.65 
 
 
1046 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  28.78 
 
 
967 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  31.99 
 
 
967 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.58 
 
 
983 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 
996 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 
973 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.78 
 
 
1023 aa  405  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.39 
 
 
1011 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.1 
 
 
1015 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  28.57 
 
 
975 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.85 
 
 
1034 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 
1014 aa  399  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 
1070 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.03 
 
 
930 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 
1032 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.08 
 
 
1023 aa  366  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 
1013 aa  343  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.75 
 
 
1013 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  27.74 
 
 
1013 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.86 
 
 
1013 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 
1013 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 
1013 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
1002 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 
1013 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.82 
 
 
1013 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 
1013 aa  335  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
1006 aa  334  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.95 
 
 
1023 aa  331  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.14 
 
 
1015 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
1026 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>