More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2844 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.96 
 
 		 1050 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.25 
 
 		 948 aa  814    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  46.42 
 
 		 1050 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.06 
 
 		 944 aa  768    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.65 
 
 		 995 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.3 
 
 		 974 aa  758    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.42 
 
 		 950 aa  791    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  100 
 
 		 949 aa  1896    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.33 
 
 		 966 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  42.99 
 
 		 1043 aa  714    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  41.78 
 
 		 984 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 		 976 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.26 
 
 		 1022 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.05 
 
 		 973 aa  793    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  46.11 
 
 		 1050 aa  733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  52.43 
 
 		 987 aa  897    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.2 
 
 		 1006 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.15 
 
 		 1031 aa  718    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 999 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  45.3 
 
 		 1010 aa  714    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  41.39 
 
 		 1013 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  42.28 
 
 		 1024 aa  681    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  42.05 
 
 		 1015 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.89 
 
 		 989 aa  756    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  47.6 
 
 		 997 aa  731    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  47.02 
 
 		 985 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  51.05 
 
 		 976 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.18 
 
 		 1028 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.73 
 
 		 997 aa  740    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  51.22 
 
 		 894 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.76 
 
 		 906 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.95 
 
 		 1000 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.58 
 
 		 947 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.74 
 
 		 945 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  46.32 
 
 		 1052 aa  729    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.15 
 
 		 1037 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  45.48 
 
 		 975 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.42 
 
 		 999 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  45.19 
 
 		 993 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.01 
 
 		 977 aa  632  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.51 
 
 		 995 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.71 
 
 		 990 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.39 
 
 		 990 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.21 
 
 		 990 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 962 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.91 
 
 		 983 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 		 974 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  36.69 
 
 		 952 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 		 973 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 		 978 aa  466  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.67 
 
 		 989 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  33.81 
 
 		 973 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.46 
 
 		 1005 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.65 
 
 		 1007 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.3 
 
 		 976 aa  436  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.69 
 
 		 1046 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.97 
 
 		 1007 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.15 
 
 		 984 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.12 
 
 		 961 aa  426  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.66 
 
 		 1015 aa  426  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.25 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.07 
 
 		 991 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  33.4 
 
 		 967 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.22 
 
 		 967 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  29.39 
 
 		 975 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.04 
 
 		 971 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.17 
 
 		 1025 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.49 
 
 		 976 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  30.74 
 
 		 930 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32 
 
 		 1009 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.73 
 
 		 1023 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  33.4 
 
 		 1014 aa  402  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  32.12 
 
 		 996 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.23 
 
 		 1032 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.28 
 
 		 977 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 		 1070 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 1055 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.38 
 
 		 968 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.35 
 
 		 1025 aa  389  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 		 1032 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.21 
 
 		 1035 aa  382  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.97 
 
 		 983 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  30.62 
 
 		 1024 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1011 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.36 
 
 		 1034 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.86 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 1017 aa  333  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 1017 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.28 
 
 		 1015 aa  332  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.78 
 
 		 1017 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.73 
 
 		 1015 aa  330  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 1006 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  27.22 
 
 		 1002 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  29.77 
 
 		 1009 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  30.72 
 
 		 1017 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  32.52 
 
 		 978 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 		 1006 aa  321  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 		 1013 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1021 aa  321  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>