More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0626 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.69 
 
 		 976 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.51 
 
 		 977 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  39.01 
 
 		 967 aa  675    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.45 
 
 		 971 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 930 aa  1935    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  38.41 
 
 		 975 aa  656    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  38.28 
 
 		 967 aa  641    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.17 
 
 		 991 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.74 
 
 		 1009 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 		 1011 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.62 
 
 		 968 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.15 
 
 		 1034 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.32 
 
 		 983 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 		 976 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 978 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  35.21 
 
 		 973 aa  571  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  35.16 
 
 		 952 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.3 
 
 		 962 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.05 
 
 		 989 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.48 
 
 		 984 aa  515  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.3 
 
 		 961 aa  512  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.54 
 
 		 996 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.44 
 
 		 983 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  33.27 
 
 		 1007 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.51 
 
 		 995 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.12 
 
 		 1015 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.37 
 
 		 1005 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.17 
 
 		 1038 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.78 
 
 		 990 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 1014 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 		 1025 aa  486  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.57 
 
 		 990 aa  485  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.93 
 
 		 1007 aa  486  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  33.06 
 
 		 973 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.08 
 
 		 990 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.76 
 
 		 1025 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 		 1032 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  32.92 
 
 		 974 aa  476  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.62 
 
 		 1032 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.78 
 
 		 1023 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 1024 aa  468  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.76 
 
 		 1035 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.94 
 
 		 1046 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 		 1055 aa  466  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 		 1070 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 		 1023 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  31.32 
 
 		 1024 aa  452  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.97 
 
 		 1031 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.72 
 
 		 945 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  30.98 
 
 		 976 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.42 
 
 		 950 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  31.5 
 
 		 984 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 		 987 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.36 
 
 		 966 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  30.24 
 
 		 1013 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 1015 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.11 
 
 		 989 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1000 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  30.78 
 
 		 1043 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.17 
 
 		 948 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.78 
 
 		 973 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 		 1037 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 		 975 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 1052 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1050 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  30.31 
 
 		 949 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 		 1050 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 		 976 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 		 944 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.57 
 
 		 999 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.12 
 
 		 974 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 1022 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 999 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.07 
 
 		 947 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 1012 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 		 985 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 997 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.18 
 
 		 1024 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.32 
 
 		 995 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 		 1028 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.12 
 
 		 1050 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 1002 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.42 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  30.27 
 
 		 894 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 		 1010 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.83 
 
 		 906 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 		 1006 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 1024 aa  366  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 		 1009 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  28.59 
 
 		 997 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1014 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 		 993 aa  354  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 1005 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.64 
 
 		 1013 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.66 
 
 		 1015 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.26 
 
 		 1015 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 		 1013 aa  350  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  28.76 
 
 		 1018 aa  350  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1013 aa  350  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 		 1013 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>