More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1163 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.56 
 
 
1005 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.33 
 
 
990 aa  981    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 
976 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.81 
 
 
1032 aa  931    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  62.37 
 
 
984 aa  1217    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.75 
 
 
1038 aa  937    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.2 
 
 
1025 aa  947    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.06 
 
 
1025 aa  962    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.39 
 
 
983 aa  942    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 
978 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
961 aa  1987    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.52 
 
 
1046 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.59 
 
 
995 aa  986    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.87 
 
 
1007 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  53.33 
 
 
1007 aa  996    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.58 
 
 
989 aa  1172    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  53.49 
 
 
974 aa  920    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  69.83 
 
 
973 aa  1382    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.68 
 
 
990 aa  985    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
973 aa  672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.16 
 
 
990 aa  980    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  41.73 
 
 
952 aa  634  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.59 
 
 
1011 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.04 
 
 
983 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.55 
 
 
977 aa  586  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.22 
 
 
991 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.34 
 
 
962 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.97 
 
 
976 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.32 
 
 
1009 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.77 
 
 
971 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  36.66 
 
 
1014 aa  565  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.8 
 
 
968 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.9 
 
 
1034 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  35.19 
 
 
975 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  36.86 
 
 
967 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  33.3 
 
 
967 aa  549  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  34.8 
 
 
996 aa  543  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.31 
 
 
1024 aa  544  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.07 
 
 
1015 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.32 
 
 
1013 aa  542  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.28 
 
 
1055 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  35.55 
 
 
1070 aa  538  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  36.13 
 
 
1024 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
1015 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.9 
 
 
1035 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  34.4 
 
 
1032 aa  519  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.63 
 
 
999 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.75 
 
 
1023 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  34.3 
 
 
930 aa  512  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
999 aa  512  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.33 
 
 
1023 aa  503  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  33.47 
 
 
976 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.88 
 
 
984 aa  496  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 
950 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  33.78 
 
 
1050 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.27 
 
 
1031 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 
987 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  34.09 
 
 
1050 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
1037 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.3 
 
 
966 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 
1043 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 
1052 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.23 
 
 
948 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.09 
 
 
1022 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.93 
 
 
973 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  33.81 
 
 
976 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.67 
 
 
989 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.71 
 
 
945 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 
1000 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.44 
 
 
997 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 
985 aa  426  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
975 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.73 
 
 
974 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.58 
 
 
906 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 
1006 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  33.12 
 
 
949 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 
1002 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 
944 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.21 
 
 
1050 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  34.52 
 
 
894 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.72 
 
 
1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.94 
 
 
1006 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  31.64 
 
 
997 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 
1010 aa  389  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.85 
 
 
947 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 
1024 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 
995 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.56 
 
 
977 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.07 
 
 
1013 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 
1027 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  31.23 
 
 
993 aa  364  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 
1022 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
1012 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.4 
 
 
1026 aa  356  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
1023 aa  356  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  27.91 
 
 
1011 aa  353  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.59 
 
 
1013 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  27.88 
 
 
1016 aa  351  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 
1023 aa  351  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 
1013 aa  350  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>