More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0764 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  58.12 
 
 
945 aa  1033    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  47.27 
 
 
1010 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.45 
 
 
977 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  49.04 
 
 
1015 aa  936    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  52.26 
 
 
976 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  52.63 
 
 
949 aa  907    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.73 
 
 
966 aa  826    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
987 aa  1962    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  47.44 
 
 
984 aa  894    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.95 
 
 
1050 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  49.35 
 
 
985 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  51.1 
 
 
975 aa  872    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  52.66 
 
 
1050 aa  901    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.69 
 
 
974 aa  858    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.99 
 
 
1006 aa  864    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.17 
 
 
1031 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.65 
 
 
948 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  45.5 
 
 
999 aa  829    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.77 
 
 
947 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.95 
 
 
950 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  45.2 
 
 
993 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  46.93 
 
 
1013 aa  882    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  48.54 
 
 
997 aa  822    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  50.92 
 
 
1024 aa  932    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.04 
 
 
973 aa  879    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.25 
 
 
989 aa  800    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  52.35 
 
 
1050 aa  899    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.89 
 
 
944 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.2 
 
 
999 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.97 
 
 
995 aa  756    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.79 
 
 
1028 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.37 
 
 
1022 aa  931    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  45.72 
 
 
976 aa  846    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.98 
 
 
997 aa  774    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.56 
 
 
906 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.76 
 
 
1000 aa  869    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  51.61 
 
 
1052 aa  898    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  51.15 
 
 
1043 aa  926    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  53.43 
 
 
894 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.06 
 
 
1037 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.75 
 
 
978 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.52 
 
 
976 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.68 
 
 
1023 aa  560  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.57 
 
 
952 aa  555  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  36.65 
 
 
973 aa  549  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.49 
 
 
995 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.04 
 
 
1015 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.66 
 
 
1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 
1024 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 
1007 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 
989 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 
983 aa  532  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.7 
 
 
990 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
1055 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 
990 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.7 
 
 
1005 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.24 
 
 
990 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.41 
 
 
1046 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  35.84 
 
 
973 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 
1032 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.03 
 
 
1014 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.25 
 
 
984 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  34.68 
 
 
996 aa  507  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.48 
 
 
1035 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.63 
 
 
1025 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  34.87 
 
 
1070 aa  508  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  37.04 
 
 
974 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.27 
 
 
977 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 
962 aa  502  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  30.98 
 
 
967 aa  501  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
983 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 
1009 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  35.45 
 
 
967 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.87 
 
 
991 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.8 
 
 
1038 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  31.17 
 
 
975 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.23 
 
 
971 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.78 
 
 
1025 aa  489  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  35.49 
 
 
1032 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.85 
 
 
976 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.02 
 
 
961 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.51 
 
 
1023 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.66 
 
 
1011 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.8 
 
 
1034 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.5 
 
 
968 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  30.52 
 
 
930 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
1012 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  31.9 
 
 
978 aa  343  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 
1027 aa  341  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  26.48 
 
 
1002 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 
1006 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.69 
 
 
1010 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.11 
 
 
1024 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.14 
 
 
1020 aa  336  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 
1017 aa  335  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  28.47 
 
 
1009 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  27.12 
 
 
1013 aa  331  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2062  FAD linked oxidase  26.03 
 
 
1010 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  24.52 
 
 
1031 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  27.03 
 
 
1011 aa  327  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>