More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1787 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.18 
 
 		 1050 aa  924    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.73 
 
 		 945 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.88 
 
 		 1022 aa  747    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.21 
 
 		 947 aa  968    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  57.85 
 
 		 989 aa  993    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.05 
 
 		 999 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.72 
 
 		 1037 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  46.56 
 
 		 993 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  51.04 
 
 		 949 aa  812    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.92 
 
 		 973 aa  990    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.69 
 
 		 966 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  42.05 
 
 		 984 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  46.44 
 
 		 1050 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  41.16 
 
 		 976 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  47.35 
 
 		 1043 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  51.69 
 
 		 976 aa  835    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.59 
 
 		 995 aa  925    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.79 
 
 		 950 aa  1095    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  52.49 
 
 		 987 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  55.19 
 
 		 997 aa  928    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  46.3 
 
 		 1052 aa  704    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  46.65 
 
 		 1050 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.57 
 
 		 1006 aa  973    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.18 
 
 		 1031 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  56.48 
 
 		 985 aa  944    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 999 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.68 
 
 		 944 aa  1032    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.73 
 
 		 977 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  41.78 
 
 		 1013 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  56.03 
 
 		 974 aa  975    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  46 
 
 		 1024 aa  744    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  53.76 
 
 		 894 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  53.59 
 
 		 1010 aa  920    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.33 
 
 		 1028 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  42.13 
 
 		 1015 aa  723    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  54.96 
 
 		 975 aa  925    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.86 
 
 		 997 aa  885    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.45 
 
 		 906 aa  933    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.38 
 
 		 1000 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 948 aa  1861    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.34 
 
 		 952 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 983 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.93 
 
 		 1007 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.02 
 
 		 1007 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.89 
 
 		 984 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 		 989 aa  492  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.76 
 
 		 1005 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.73 
 
 		 990 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.95 
 
 		 990 aa  485  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 		 974 aa  486  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  34.59 
 
 		 973 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.95 
 
 		 990 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.04 
 
 		 978 aa  482  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.66 
 
 		 995 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  34.44 
 
 		 973 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  30.94 
 
 		 967 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.31 
 
 		 1038 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 		 1055 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1025 aa  465  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.72 
 
 		 1046 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  31.08 
 
 		 975 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.23 
 
 		 961 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 976 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.57 
 
 		 962 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.22 
 
 		 991 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.87 
 
 		 1025 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  34.15 
 
 		 967 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.49 
 
 		 1024 aa  452  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 		 1032 aa  449  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.28 
 
 		 1009 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.61 
 
 		 971 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 		 1070 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.49 
 
 		 1015 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  34.31 
 
 		 1014 aa  442  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.71 
 
 		 976 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34 
 
 		 1035 aa  442  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.15 
 
 		 977 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.45 
 
 		 1011 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.41 
 
 		 983 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 968 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.06 
 
 		 996 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  30.17 
 
 		 930 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.12 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 1032 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1023 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.7 
 
 		 1013 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 		 1013 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 		 1013 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1013 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2548  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.14 
 
 		 1016 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 		 1013 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1013 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 		 1013 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1013 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  28.41 
 
 		 1002 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 1013 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.78 
 
 		 1019 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 		 1006 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1023 aa  357  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>