More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5581 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  61.31 
 
 		 985 aa  1068    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  43.59 
 
 		 993 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.29 
 
 		 989 aa  878    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  40.99 
 
 		 1015 aa  711    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  49.7 
 
 		 976 aa  811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.78 
 
 		 944 aa  944    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  43.26 
 
 		 1043 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 		 976 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  54.16 
 
 		 975 aa  964    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  48.36 
 
 		 949 aa  754    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.14 
 
 		 966 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.54 
 
 		 1022 aa  750    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  40.38 
 
 		 984 aa  690    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  59.25 
 
 		 997 aa  1062    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.24 
 
 		 945 aa  799    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  59.6 
 
 		 974 aa  1128    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  45.82 
 
 		 1050 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.58 
 
 		 1006 aa  1185    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.92 
 
 		 1031 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.52 
 
 		 947 aa  971    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  45.1 
 
 		 1050 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  57.86 
 
 		 1010 aa  1077    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 1050 aa  2036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.52 
 
 		 1037 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  40.92 
 
 		 1013 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  49.25 
 
 		 894 aa  732    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  43.96 
 
 		 1024 aa  736    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.68 
 
 		 948 aa  961    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  45.67 
 
 		 1052 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.95 
 
 		 995 aa  979    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.87 
 
 		 1028 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.4 
 
 		 950 aa  961    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.77 
 
 		 997 aa  925    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.6 
 
 		 977 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.4 
 
 		 906 aa  813    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.46 
 
 		 1000 aa  695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  50.91 
 
 		 987 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.23 
 
 		 973 aa  1101    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.81 
 
 		 999 aa  635  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 999 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  35.72 
 
 		 973 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.19 
 
 		 978 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.46 
 
 		 976 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  37.39 
 
 		 952 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.71 
 
 		 1007 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.27 
 
 		 984 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.53 
 
 		 991 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.38 
 
 		 983 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 962 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.67 
 
 		 961 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.39 
 
 		 1009 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.93 
 
 		 990 aa  433  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.33 
 
 		 1005 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.8 
 
 		 990 aa  429  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.43 
 
 		 990 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 1038 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.58 
 
 		 983 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.64 
 
 		 989 aa  426  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.1 
 
 		 995 aa  426  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.6 
 
 		 1046 aa  426  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 		 974 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.86 
 
 		 968 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 		 971 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.79 
 
 		 1007 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.9 
 
 		 976 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  28.21 
 
 		 975 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  34.04 
 
 		 1014 aa  412  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.76 
 
 		 1032 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  31.74 
 
 		 1055 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.82 
 
 		 1025 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  31.1 
 
 		 973 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  32.44 
 
 		 1024 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.69 
 
 		 967 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.5 
 
 		 930 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 		 996 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 		 1035 aa  396  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.32 
 
 		 977 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 1025 aa  396  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  32.43 
 
 		 967 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 		 1070 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.59 
 
 		 1015 aa  389  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.36 
 
 		 1034 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.86 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.56 
 
 		 1032 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.65 
 
 		 1023 aa  360  7e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 1002 aa  337  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 		 1006 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.6 
 
 		 1023 aa  307  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  26.35 
 
 		 1016 aa  301  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1013 aa  299  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  29.57 
 
 		 1010 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  26.76 
 
 		 1013 aa  297  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.67 
 
 		 1027 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.84 
 
 		 1015 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1013 aa  296  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 		 1013 aa  295  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  27.66 
 
 		 1009 aa  294  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.2 
 
 		 1013 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 1024 aa  294  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>